As ações da SAA/SP direcionadas para os Arranjos Produtivos Locais são instituídas pelo Painel de Estudos em Arranjos Produtivos Locais Agroindustriais Rurais – PEA/SAA-SP (RES.69/21), o qual aponta a diretrizes e da os contornos institucionais e técnicos da referida política buscando a sustentabilidade econômica, social e ambiental das cadeias e territórios nos quais se encontram os APL Agroindustriais Rurais do Estado de São Paulo.

A partir da assinatura do Termo de Cooperação Técnica entre SAA/SP e SDE/SP, em agosto de 2021 (esta última gestora da política pública estadual voltada para APL oriundos de todos os setores da economia) a expertise técnica e cientifica da SAA/SP foi posta para fortalecer a atuação multidisciplinar por meio da participação de servidores públicos da CATI-SAA/SP, APTA-SAA/SP, CDA-SAA/SP e ATG-SAA/SP (Res.74/21), operacionalizando a transversalidade promovendo assim, o  diálogo entre as fronteiras do saber de maneira permanente e cooperativa,  redirecionando as linhas das fronteiras entre conhecimentos técnicos e científicos para colaborar com os cidadãos do meio rural na criação de novos modos de produção, comercialização e gestão dos negócios agropecuários.